An integrated pipeline to count individual transcripts with single-cell resolution
本文提出了一种结合了 HCR、共聚焦显微镜和定制分析工具的集成实验与计算流程,旨在实现对完整秀丽隐杆线虫不同发育阶段内敏感、特异且绝对的单细胞转录本计数,从而促进对基因调控和细胞异质性的研究。
307 篇论文
分子生物学探索着生命的核心密码,揭示基因如何运作、蛋白质怎样构建以及细胞如何交流。这一领域不再只是实验室里的深奥理论,而是理解疾病、开发新药甚至解读自身健康的关键。在 Gist.Science,我们致力于打破学术壁垒,让这些前沿发现触手可及。
本栏目收录的所有预印本均源自 bioRxiv。我们团队会逐一处理该分类下发布的最新预印本,为每一篇论文提供通俗易懂的科普解读与详尽的技术摘要,无论您是专业研究者还是科学爱好者,都能轻松掌握核心发现。
以下是该领域最新发布的预印本论文列表,欢迎浏览探索。
本文提出了一种结合了 HCR、共聚焦显微镜和定制分析工具的集成实验与计算流程,旨在实现对完整秀丽隐杆线虫不同发育阶段内敏感、特异且绝对的单细胞转录本计数,从而促进对基因调控和细胞异质性的研究。
本研究表明,乙型肝炎病毒碱基核心启动子(BCP)突变增强了病毒复制并使肝细胞发生转录重编程,从而激活癌症相关通路,进而定义了一种独特的肝细胞癌分子亚型。
这项研究确定了 SARS-CoV-2 nsp1 N 端结构域内两个特定的表面暴露残基簇,它们对于区分病毒 mRNA 与宿主 mRNA 以及触发 mRNA 降解至关重要,从而解释了病毒如何逃避自身的翻译抑制机制。
这项研究表明,阿片受体拮抗剂纳洛酮通过抑制 NOX2 驱动的氧化应激,能够挽救 LCHADD/VLCADD 3D 生物打印模型中的线粒体形态并恢复血管化,提示其作为这些患者代谢危象挽救疗法的潜力。
这项研究表明,人类蛋白质中的正向选择主要针对暴露的细胞外区域和病原体相互作用界面,这表明宿主与病原体的冲突驱动了适应性进化,同时也表明这些经进化选择的残基是极具前景的治疗靶点。
本研究确定了 *Wolbachia pipientis* 蛋白 WD0754 是通过激活宿主的 IMD 信号通路,从而赋予黑腹果蝇对病毒感染产生抗性的关键因子。
本研究确定了 LARP1-DM15/Sgt 是一个识别 TOP 核糖体蛋白 mRNA 上靠近帽结构的 2'-O-核糖甲基化 (cOMe),从而稳定这些 mRNA 并促进其定位至 Drosophila 突触,进而支持局部蛋白质合成以维持突触功能的阅读复合物。
本研究表明,具有不同高变区(HVR)插入序列的戊型肝炎病毒变体在原代人肝细胞中会引发截然不同的先天免疫反应,其中 HVR 重复变体触发了显著较弱的抗病毒反应,并提示病毒复制与宿主免疫诱导之间存在正相关关系。
该研究介绍了一种多载体RNA末端连接(REJ)系统,该系统利用细胞内源性的剪接体,将分裂的AAV载体重新组装成大型治疗性蛋白质,并证明了其在预防杜氏肌营养不良症模型中肌肉变性方面,能够高效、安全且有效地恢复抗肌萎缩蛋白的表达。
这项研究表明,虽然 DNA-PK 抑制剂在编辑的人类造血干细胞和祖细胞中适度增加了大型靶向缺失,但并未显著提高全基因组范围内的结构变异,然而,由编辑引起的结构变异的固有风险使得对所有治疗方案(特别是涉及多个同时编辑的方案)进行仔细的安全评估变得十分必要。